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〔記者吳佳蓉／台北報導〕針對學校產學合作營業稅爭議。財政部解釋，產學合作收入課徵營業稅，並不會造成額外稅負負擔，營業稅屬代徵性質，學校可直接將5％營業稅增加在專利售價上，合作企業雖得以更高價格購入，但也會因此多出營業稅進項稅額可扣抵，一增一減後，負擔不會增加。
財政部官員解釋，在新解釋令今年1月8日上路前，長久以來都依照1986年頒佈的解釋令，在處理學校產學合作收入的營業稅問題，當時研議的基礎法規為「建教合作辦法」，但該法幾經變更，最終廢止，且隨產學合作型態漸增，當初的解釋令不再合用，勢必有調整需求，才會在今年初頒佈新的遊戲規則。
官員表示，新的課稅方式也訂有日出條款，今年元旦起才適用，沒有回溯課徵問題。檢視產學合作收入，除了人才培育收入與提供教育勞務目的相近外，其餘收入，如智慧財產權運用收入、技術移轉收入等，性質比較接近「銷售教育勞務」，才會認定有課徵營業稅必要。
官員指出，不然將造成民間企業提供技術移轉給鴻海、台積電要課營業稅，但大學做一樣的事就免稅的不同調情形。加上營業稅為代收性質，對學校及合作企業來說，都不會造成額外負擔；學校可將營業稅增加至專利等服務的售價上，假設原本賣100萬，增加為105萬元。
合作的企業雖然取得專利成本變高，但因為也同時獲得5萬元的進項稅額可在計算營業稅時扣抵，因此，整體負擔不會加重；在申報營所稅時，也有更多成本費用可扣抵。
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